বাংলাদেশ মৎস গবেষণা ইনস্টিটিউট দেশের মৎস্য খাতের উন্নয়নে একমাত্র জাতীয় গবেষণা প্রতিষ্ঠান। এটি ১৯৮৪ সালে রাষ্ট্রপতির অধ্যাদেশ বলে প্রতিষ্ঠিত হয়। ময়মনসিংহে এর সদর দফতর। জাতীয় চাহিদার নিরিখে নিবিড় গবেষণা পরিচালনার মাধ্যমে ইনস্টিটিউট থেকে এ পর্যন্ত মৎস্য চাষ ও ব্যবস্থাপনাবিষয়ক ৫৭টি প্রযুক্তি উদ্ভাবন করা হয়েছে। পাঁচটি কেন্দ্র ও পাঁচটি উপকেন্দ্র থেকে এসব গবেষণা কার্যক্রম পরিচালনা করা হয়। আর এসব কার্যক্রম হলো : ময়মনসিংহ স্বাদুপানি কেন্দ্র, চাঁদপুরে নদী কেন্দ্র, খুলনার পাইকগাছায় লোনাপানি কেন্দ্র, কক্সবাজারে সামুদ্রিক মৎস্য ও প্রযুক্তিকেন্দ্র এবং বাগেরহাটে চিংড়ি গবেষণাকেন্দ্র। আর উপকেন্দ্রগুলো হলো : রাঙ্গামাটিতে নদী উপকেন্দ্র, বগুড়াতে সান্তাহার প্লাবনভূমি উপকেন্দ্র, যশোরে স্বাদুপানি উপকেন্দ্র, খেপুপাড়াতে নদী উপকেন্দ্র এবং সৈয়দপুরে স্বাদুপানি উপকেন্দ্র।
ইনস্টিটিউটের প্রধান লক্ষ্য গোটা জলজ জীবসম্পদের উন্নয়ন ও সর্বোত্তম ব্যবহার সম্পর্কিত মৌলিক ও ফলিত গবেষণা পরিচালনা; উন্নত মাছচাষ ও ব্যবস্থাপনার সাশ্রয়ী, স্বল্প-শ্রমঘন, পরিবেশ অনুকূল প্রযুক্তি উদ্ভাবন; চিংড়িসহ বাণিজ্যিকভাবে গুরুত্বপূর্ণ মৎস্যসম্পদ সংগ্রহ ও সংরক্ষণের প্রযুক্তি উদ্ভাবন; এবং প্রশিক্ষণ ও প্রদর্শনের মাধ্যমে দক্ষ জনশক্তি গড়ে তোলা।
মহাপরিচালক এ ইনস্টিটিউটের প্রধান। বাংলাদেশ সরকারের মৎস্য ও পশুসম্পদ মন্ত্রণালয়ের মন্ত্রীর সভাপতিত্বে একটি বোর্ড অব গভর্নরের উপর ইনস্টিটিউট পরিচালনা, প্রশাসন ও তদারকির দায়িত্ব ন্যস্ত। ইনস্টিটিউটের সদর দফতর রাজধানী ঢাকা থেকে প্রায় ১২০ কিলোমিটার উত্তরে ময়মনসিংহে অবস্থিত। সদর দফতর ছাড়াও সংস্থার চারটি গবেষণা স্টেশন রয়েছে: স্বাদুপানির মাছচাষ গবেষণার জন্য ময়মনসিংহের স্বাদুপানির স্টেশন (Freshwater Station); নদীর মৎস্যসম্পদ ব্যবস্থাপনা ও উন্নয়নের জন্য
স্বাদুপানির স্টেশনের ৪০ হেক্টরের চত্বরটি ময়মনসিংহে বাংলাদেশ কৃষি বিশ্ববিদ্যালয়ের সন্নিকটে অবস্থিত। এই স্টেশনে আছে ০.০৪-০.০৬২ হেক্টর আয়তনের ১১৮টি নিষ্কাশনযোগ্য পরীক্ষামূলক পুকুর এবং বছরে ৩০ কোটির বেশি পোনা-উৎপাদনক্ষম একটি সুসজ্জিত ও অত্যাধুনিক কার্প-হ্যাচারি।
বাংলাদেশে মৎস্যচাষ গবেষণার ক্ষেত্রে টেকনিক্যাল তথ্যাদি নথিভুক্তির একটি আনুষ্ঠানিক ব্যবস্থা গড়ে তোলার চাহিদা পূরণের উদ্দেশ্যে বাংলাদেশ মৎস্য গবেষণা ইনস্টিটিউট সদর দফতরে একটি গ্রন্থাগার ও দলিলপত্র সংরক্ষণ কেন্দ্র প্রতিষ্ঠা করেছে। গ্রন্থাগারে আছে প্রায় ২,৬০০ টি টেকনিক্যাল ও সাধারণ বইপত্র এবং ৮৩টি বিজ্ঞান বিষয়ক সাময়িকী।
ইনস্টিটিউটের নিয়মিত ও অনিয়মিত প্রকাশনার মধ্যে রয়েছে গবেষণা ফলাফল, বার্ষিক প্রতিবেদন, তথ্যবার্তা, সাময়িকী, নির্দেশিকা, গবেষণা রিপোর্ট এবং সম্মেলন, সেমিনার ও কর্মশালার কার্যবিবরণী, প্রশিক্ষণ ম্যানুয়েল, সম্প্রসারণ সামগ্রী, পুস্তিকা, প্রচারপত্র ও পোস্টার। ইনস্টিটিউটের গবেষণা কার্যক্রম বিভিন্ন বিশ্ববিদ্যালয়, গবেষণা সংস্থা ও অন্যান্য দেশী ও বিদেশী প্রতিষ্ঠানের সঙ্গে ঘনিষ্ঠ সহযোগিতার মাধ্যমে পরিচালিত হয়ে থাকে। মৎস্যচাষ উন্নয়নের প্রযুক্তি সম্প্রসারণে দেশে কর্মরত বিভিন্ন বেসরকারি সংস্থার সঙ্গেও ইনস্টিটিউট নিবিড় যোগাযোগ রক্ষা করে। [এস.এস হুমায়ুন কবির]